如今，计算机系统被广泛应用于中小农业企业的生产经营中去。常见的应用于中小农业企业的计算机系统包括以下几种：
第一、中小农业企业财务管理计算机系统
该项系统借助于计算机系统以及相关的财务软件，实现中小农业企业财务管理的功能。包括会计凭证的审核，录入，汇总，编制等等，同时将中小农业企业的财务管理系统与其他计算机管理系统实现无缝对接，有效地对中小农业企业实现全面管理。
第二、中小农业企业进销存管理信息系统
该项系统依赖于成熟的计算机软件以及电子信息化管理系统，实现包括进货管理，销售统计，仓库管理的功能，能够帮助中小农业企业了解自身经营状况，实现企业内部成本核算与管控的功能，能够最大化仓库使用价值。
第三、中小农业企业人事管理信息系统
中小农业企业人事管理信息系统主要通过计算机软件以及常用的无线设备，实现企业内部人员管理，人事招录，内部文件共享的功能。中小农业企业为了寻求更为宽广的发展，必须实现高效的人事管理系统，这时候一套运行良好，性能稳定的计算机系统就能够充分满足中小农业企业的相关需求。中小农业企业人事管理系统的功能主要包括人力资源的合理分配，人力资源档案的合理管理，人力资源工资薪酬的合理计算等等。第四，中小农业企业固定资产管理信息系统。该项系统掌握在中小农业企业高层管理者手中，利用计算机系统实现企业固定资产的综合管理，实现对中小农业企业固定资产的录入，检查，维护，统计等功能。
