首先是企业在很大程度上依赖计算机对企业的管理而忽略了企业自身的管理。不论是哪种类型的企业都要对自身有清晰的认识，明确自身所属的管理制度。不同的企业面临不同的问题，同样也会有不同的解决方案，只有结合自身发展情况，清楚自己企业发展存在的问题才能找到正确的解决方法，这也才是企业正确的发展道路；其次，企业自身的信息化目标不是很明确。不论企业是以怎样的心态引进信息化办公的，他们对于信息化的转变都必须要有明确的目标。部分企业对信息化持怀疑的态度，在要不要采用信息化办公边缘徘徊，还有一些企业仅仅是盲目地跟随潮流，对自己企业未来的信息化发展目标并不明确。这一问题在很大程度上会导致企业的成本不明晰以及管理混乱等，进而减弱在市场中的竞争优势；
再次，对企业信息化的理解有误。这一问题在大型以及国有企业中几乎不存在，但是在小型企业中却很常见，因为大部分小型企业对企业信息化的理解不够透彻。由于企业进入信息化的过程需要耗费大量资金，因此，小型企业在面临如此选择时就会表现的异常谨慎。在下定决心使用后，又由于对信息化抱有较大的希望，将信息化的功能扩大化，从而忽略自身对企业的管理而导致企业面临巨大的风险；
最后，企业信息化面临巨大的资金挑战。前面所述，中小型企业在进行企业信息化改革时，面临很大的资金问题，事实上无论企业的规模多大，都会遇到这一问题。在企业趋于信息化的初步阶段，企业的资金问题会对企业信息化的进一步发展产生阻碍，尤其是在后期进行系统维护时，更是需要大量的资金作技术上的支撑。
